여성들의 성기능 장애는 남성의 그것만큼 흔하지만 치료의 대상이 되는 경우는 거의 없다. 성 행위시 여성의 성적 역할이 수동적이란 게 가장 큰 이유지만, 불감증 등을 병으로 인식하지 않고, 병원 치료로 해결될 문제도 아니라고 생각하는 것도 중요한 이유가 된다. 그러나 최근엔 여성 성기능 장애를 전문으로 다루는 의사와 병원들이 늘어나고 있다.

여성 성기능 장애에는 흔히 불감증이라 부르는 성적각성장애와 오르가즘장애가 대표적이지만 병원을 찾는 이유는 대부분 성교통이나 질경련 때문이다.

성교통은 성에 대한 부정적 인식과 같은 정신적 원인, 처녀막이나 음순의 열상(裂傷)과 같은 외상, 질 표면의 염증이나 궤양이나 피부병, 불충분한 애무, 생식기의 구조적 이상, 자궁내막증, 골반염, 폐경으로 인한 질 건조증 등이 원인이다. 성교통 완화를 위해 윤활제나 마취연고를 사용하는 사람이 많으며, 실제로 도움이 되는 경우도 많다. 그러나 숨어있는 병이 성교통의 원인일 수 있으므로 통증이 심한 경우엔 일단 의사의 진찰을 받아 보는 게 좋다.

질경련은 남성 성기의 삽입을 막으려는 무의식 때문에 대부분 비롯되는데 성교통이 함께 나타나는 경우가 많다. 거꾸로 성교통에 대한 고통스런 기억이 질경련의 원인이 되기도 한다. 그 밖에 임신에 대한 두려움, 남자에게 조정당한다는 생각, 성 행위가 폭력이라는 생각 등이 질경련을 유발할 수도 있다. 정신과 상담을 받으면서 질 근육을 이완시키는 훈련을 받으면 대부분 증상이 호전된다.

한편 흔히 불감증이라 부르는 성적각성장애는 적절한 성적 자극이 주어져도 흥분이 되지 않는 상황을 일컫는다. 부부 싸움, 정신적 스트레스, 성에 대한 죄의식, 자신의 신체에 대한 나쁜 이미지 등 정신적 원인인 경우가 많으며, 갑상선질환, 말초 또는 중추신경계 질환, 자궁질환, 근육질환, 약물복용 등이 원인이 될 수도 있다. 전체 여성의 약 10%에게 나타나는 오르가즘장애는 불충분한 애무, 부적절한 성관계, 성에 대한 죄의식 등이 원인이 된다. 성적각성장애나 오르가즘장애가 정신적인 문제서 비롯되며 지속된다면 정신과 전문의의 치료를 받아야 한다.